Атанасий Велики бил погребан в Александрия в църквата Вуколия,където била гробницата на апостол Марк и неговите приемници на Александрийската катедра.
Пренасянето на мощите на преподобния Атанасий от Александрия в Константинопол се предполага,че е станало по време на патриарх Герман,като година и месецът не са точно определени(има предположение само за датата,че е 2 май).Мощите му са били положени в храма,,Света София".През 12 век мощите на светителя се намирали в църквата на света Богородица Трианконтафилос,построена през1034 година от император Роман Трети Аргир.При превземането на Константинопол в ръцете на кръстоносците през 1204 година,ръката на преподобния Атанасий била взета от кардинал Петър Капуански и занесена в манастира,,Монте Касино".След падането на Византия под османска власт мощите били взети от венецианците и занесени във Венеция и положени в църквата,,Санта Кроче дел Джудека". През 1806 година те били пренесени в друга църква,,Свети Захарий".През 1973 година папа Павел Шести подарява пръста на свети Атанасий на коптския патриарх Шенуда Трети и бил положен в катедралата на апостол Марк в Каир,а друга частица от мощите била предадена в 1998 година на катедралата в Даманхур.